Στην περίπτωση της Ελλάδας οι επιστροφές μέσω του Κανονισμού «Δουβλίνου» έχουν παγώσει από το 2011 έπειτα από καταδίκη της χώρας στο Ευρωπαϊκό Δικαστήριο Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων. Στα τέλη του 2016 η Ευρωπαϊκή Επιτροπή ανακοίνωσε ότι από τις 15 Μαρτίου 2017 η Ελλάδα θα επανενταχτεί στο σύστημα και συνέστησε την επιστροφή των αιτούντων διεθνούς προστασίας σε αυτήν. Επίσης η Επιτροπή εργάζεται πάνω στη αναθεώρηση του Κανονισμού με προοπτική την ένταξη περαιτέρω περιοριστικών διατάξεων, με βασική αυτή του περιορισμού της πρόσβασης στο δικαίωμα οικογενειακής επανένωσης.
Η «Υποστήριξη Προσφύγων στο Αιγαίο» εργάζεται συστηματικά για την παρακολούθηση και τεκμηρίωση των συνεπειών που επιφέρουν οι πολιτικές που αναπτύσσονται με βάση το σύστημα του «Δουβλίνου» και για την ανάδειξη και αντιμετώπιση του αποκλεισμού που αυτές επιφέρουν στους πλέον ευάλωτους πληθυσμούς.